Els estudis basats en mostres d'herbari sovint requereixen l'observació microscòpica de les mostres, la qual cosa implica la creació de preparacions microscòpiques. Posteriorment, aquestes preparacions es tracten adequadament per a la seva conservació i estudi futur. Al CeDocBiV freqüentment es conserven amb la indicació del número del plec d'herbari d'on s'han extret. Destaquem les següents unitats:
- preparacions de grans de pol·len. Comprèn més de 500 preparacions de M. Asunción Suárez Cervera associades a la col·lecció de fotografies al microscopi electrònic. També inclou una col·lecció de grans de pol·len obtinguts de mostres del nostre herbari per Santiago Riera Mora i el seu equip del departament d’Història i Arqueologia de la Facultat de Geografia i Història de la UB.
- mostres d’algues microscòpiques d’aigua dolça (unes 600 preparacions), preparades principalment per Mariona Hernández Mariné
- preparacions de micromicets paràsits obtingudes de l’herbari de Taurino Mariano Losa España (1893-1966), realitzades per Francisco Pando del “Real Jardín Botánico de Madrid” (24 preparacions)
- preparacions complementàries de plecs de l'herbari, principalment de la col·lecció de líquens.
